蛋白质结构与动力学专题

2019-02-17 - 2019-02-22
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一、介绍

  • 语言
    • 中文+英文


    时间
    • 2019 年 2 月 17 - 22 日


    位置
    地点

    松山湖材料实验室,东莞

     


    组织人
    • 刘海广,储祥蔷,汤雷翰

 

二、报名

  • 学员
    • 面向物理、化学和生物物理专业研究生,及具有相关学科背景的高年级本科生和教师。


    时间
    • 即日至 2019 年 1 月 25 日。


    材料
    • 个人简历,研究生和本科生在读学校推荐老师信息。


    录取
    • 申请人入选资格由委员会审定,决定后及时通知申请人。


    联系人

    •  
    报名表

 

三、课程简介

蛋白质是实现细胞层面生命过程的基本单元,也是天然和人造药物的主要靶点。蛋白质的构象可以经物理作用如化学能、光激发乃至热涨落产生变化,实现特定的生物功能。近年来,随着高分辨实验技术的飞速发展及计算方法和硬件的提升,全原子定量描述蛋白构象变化成为越来越多研究组追求的目标。由于其巨大的分子量和所处的液态环境,驱动蛋白质构象变化的内部运动跨越超过 10 个量级的时间尺度。如何整合不同实验手段获得的数据和信息,结合先进的采样和时空轨迹表征方法,确定特定蛋白完整的构象变化及驰豫过程,仍是一个跨学科难题。

本课程由授课、前沿讲座和小组项目三部分组成。授课老师将通过实例,系统地介绍蛋白质动力学的研究方法,包括数据采集的实验技术,计算方法,以及数据的整理和分析。前沿讲座将勾画更多的研究背景和未来发展的前景。小组项目将围绕授课老师提供的课题强化学员分析问题、协作和动手能力,学校将给优质完成项目的小组颁奖。

春季学校将免费提供学习期间食宿,学员需自备电脑。

 

四、授课

1.实验方法及数据分析

谢爱华(俄克拉荷马州立大学)

  • 动态过程的高分辨红外光谱学

谭砚文(复旦大学)

  • 单分子荧光技术

李娜(中科院上海高等研究院)、 储祥蔷(工程物理研究院)

  • 小角X 射线/中子散射

高宁(北京大学)、 李赛(清华大学)

  • 冷冻电子显微镜术

 

 

2.高精度力场和粗粒化计算方法

黄旭辉(香港科技大学)

  • 马尔可夫态网络

王涵(工程物理研究院)、 唐乾元(东京大学)

  • 机器学习在分子动力学中的应用

 

 

3.前沿报告

刘海广(北京计算科学研究中心)

  • X 射线自由电子激光和时间分辨研究

杨立江(北京大学)

  • 增强采样方法

Isabella Guido(MPI for Dynamics & Self-Organization)

  • Cell motility and synthetic cell

万群(南京农业大学)

  • 中子晶体衍射